Plusieurs secteurs bénéficient d'une animation foncière spécifique, il s'agit :
- d'une partie du territoire du Haut-Jura
- du territoire du PDM du Doubs Central Rive droite
- du territoire du PDM de la Vallée de la Saône
- du territoire du PDM Loue-Lison sud
- du territoire du PDM Doubs central Rive gauche
- du territoire de Dampierre sur Linotte (70)